Begrunnelsen for nedleggelsen er at "Kilden er på siden av kjerneoppgavene til Forskningsrådet, og at oppgavene til Kilden overlapper med andre senter og fagmiljø".
Rebecca Lund og Eirinn Larsen uttaler at: "Kilden kjønnsforskning driver ikke forskning på kjønnsforskningsfeltet, men har et nasjonalt ansvar for å fremme kjønnsforskning og kjønnsperspektiver og kjønnsbalanse i forskning og innovasjon. Dette overlapper ikke direkte med oppgavene til Senter for tverrfaglige kjønnsforskning."